搜狐医药 – 剑桥大学研究:COVID-19人类首次感染传播发生在2019年9月至12月间_病毒

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原标题:搜狐医药 | 剑桥大学研究:COVID-19人类首次感染传播发生在2019年9月至12月间 出品 | 搜狐健康 作者 | 周亦川 编辑 | 袁月 英国剑桥大学研究人员在4月8日在《美国科学院院报》(PNAS)发布的一项研究指出,中国武汉的COVID-19与欧洲和美国等其他国家地区的COVID-19分属不同类型。 文章作者,英国剑桥大学遗传学家Peter Forster博士介绍,研究组对第一批160个COVID-19人类患者完整病毒基因组序列进行分析,绘制了病毒突变的原始传播图,发现这些突变创造了不同的病毒谱系。 Forster说,病毒发生了很多的快速突变,无法精确追踪COVID-19的谱系,但我们可以利用数学网络算法将所有可能的进化谱系进行可视化。这种算法常用于通过DNA分析史前人类的活动情况,这是第一次用于追踪COVID-19一类的冠状病毒感染途径。 研究人员使用了自2019.12.24至2020.3.4期间从世界各地采集的病毒基因数据,发现COVID-19存在三种不同的变体,可分为“A、B、C”三种类型。 其中,“A型”与蝙蝠和穿山甲身上发现的COVID-19最接近,即“原始人类病毒基因组”。“B型”来源于“A型”,“C型”又是由“B型”变异而来。A型病毒出现在武汉,但它不是武汉疫情爆发中主要的病毒类型。我们在居住在武汉的美国人身上发现了变异的A型病毒,同时在美国和澳大利亚患者样本中发现了大量的A型病毒。 武汉患者样本中最主要的是B型病毒,这在东亚各地的患者中普遍存在。然而,研究人员发现,它可能是东亚一个孤立的感染群体中建立起来的,如果没有进一步的突变,这种变异不会传播到世界其他地方。这意味着东亚以外的其他地区人类对B型病毒产生了“抵抗”。 另一种可能性,B型病毒在免疫和环境方面适于在东亚人群中传播,我们看到在东亚的突变率低于其他地方。或许,该病毒在东亚之外需要通过变异适应新的环境。 “C型”是欧洲样本中最主要的类型,我们在法国、意大利、瑞典和英国早期患者中发现了这种病毒。在中国大陆地区没有发现C型病毒,但存在于新加坡、中国香港和韩国的样本中。分析表明,意大利标本中的C型病毒与1月27日首先记录的德国感染病例有关,而意大利另一类感染途径与新加坡来源有关。 Forster在总结中表示,利用基因网络技术,我们可以准确追踪病毒感染途径,通过突变和病毒谱系的分析将已知病例互相关联。这种系统方法可以应用于最新的冠状病毒基因组测序,预测未来疾病传播和激增事件,遏制疾病在全球范围内进一步传播。 剑桥大学官网补充,目前,研究人员已将病毒基因组由160个扩展到1001个。现在的结果表明,COVID-19在人类首次感染和传播发生在2019年9月中旬至12月初之间。 参考资料: 1.Cambridge COVID-19: genetic network analysis provides ‘snapshot’ of pandemic origins https://www.cam.ac.uk/research/news/covid-19-genetic-network-analysis-provides-snapshot-of-pandemic-origins?from=timeline&isappinstalled=0 2.PNAS Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117 返回搜狐,查看更多